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1．應用范圍廣，適應性好
由于溶劑系統的組成及配比可以是無限多的，因而從理論上講可以適用于任何極性范圍內樣品的分離，在分離天然化合物方面具有其獨到之處。由于聚四氟乙烯管中的固定相為液體不需要固相載體，因而可以消除固-液色譜中由于使用固相載體而帶來的吸附損失，特別適用于分離極性物質。
2．操作簡便，容易掌握
儀器操作簡單，對樣品的預處理要求低，一般的粗提物即可進行的制備分離或分析。
3．回收率高
不需要固相載體，消除了由于樣品在固相載體上的不可逆吸附和降解造成的損失，理論上樣品的回收率可達。在實驗中只要調整好分離條件，一般都有很高的回收率。
4．重現性好
如果樣品不具有較強的表面活性作用，酸堿性也不強，即使多次進樣，其分離過程都保持很穩定，而且重現性相當好。
5．分離效率高，分離量較大
由于其與一般的色譜分離方式不同，能實現梯度洗脫和反相洗脫，亦能進行重復進樣，使其特別適用于制備性分離，產品純度高，制備量大。
6．分配系數
溶劑系統的選擇是同時選擇色譜分離過程的兩相，是對樣品成功分離的關鍵所在，而樣品中各組分的分配系數決定著這種溶劑系統是否合適，因此分配系數的測定是選擇溶劑系統的重要環節。目前，分配系數的測定多采用薄層色譜法、毛細管電泳法、HPLC法、生物活性分配比率法及分析型HSCCC法。
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